Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc162pQ0VG85 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc162pQ0VG85 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc162pQ0VG85 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms