Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnnm1Q0GA42 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnnm1Q0GA42 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnnm1Q0GA42 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnnm1Q0GA42 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms