Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Plac8l1Q08EJ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.7 ms