Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ssrp1Q08943 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssrp1Q08943 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssrp1Q08943 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.4 ms