Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs3Q05895 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Thbs3Q05895 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs3Q05895 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs3Q05895 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs3Q05895 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Thbs3Q05895 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Thbs3Q05895 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Thbs3Q05895 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs3Q05895 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Thbs3Q05895 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Thbs3Q05895 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms