Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apoc2Q05020 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoc2Q05020 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms