Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sox13Q04891 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox13Q04891 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox13Q04891 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms