Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Thbs2Q03350 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Thbs2Q03350 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Thbs2Q03350 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Thbs2Q03350 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms