Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fgfr4Q03142 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgfr4Q03142 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgfr4Q03142 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgfr4Q03142 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms