Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Nucb1Q02819 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nucb1Q02819 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nucb1Q02819 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nucb1Q02819 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms