Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cacna1sQ02789 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cacna1sQ02789 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cacna1sQ02789 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cacna1sQ02789 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacna1sQ02789 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cacna1sQ02789 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms