Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfiaQ02780 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfiaQ02780 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfiaQ02780 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfiaQ02780 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfiaQ02780 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfiaQ02780 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfiaQ02780 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfiaQ02780 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfiaQ02780 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NfiaQ02780 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfiaQ02780 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms