Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms