Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms