Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VcpQ01853 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VcpQ01853 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VcpQ01853 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VcpQ01853 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VcpQ01853 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VcpQ01853 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VcpQ01853 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VcpQ01853 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VcpQ01853 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VcpQ01853 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VcpQ01853 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms