Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd1Q01822 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd1Q01822 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms