Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EgfrQ01279 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EgfrQ01279 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EgfrQ01279 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EgfrQ01279 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EgfrQ01279 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EgfrQ01279 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EgfrQ01279 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EgfrQ01279 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EgfrQ01279 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EgfrQ01279 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EgfrQ01279 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EgfrQ01279 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EgfrQ01279 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EgfrQ01279 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EgfrQ01279 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EgfrQ01279 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EgfrQ01279 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EgfrQ01279 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EgfrQ01279 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EgfrQ01279 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EgfrQ01279 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EgfrQ01279 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EgfrQ01279 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EgfrQ01279 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EgfrQ01279 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EgfrQ01279 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms