Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SelpQ01102 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SelpQ01102 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SelpQ01102 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SelpQ01102 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SelpQ01102 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SelpQ01102 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SelpQ01102 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelpQ01102 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SelpQ01102 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SelpQ01102 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SelpQ01102 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SelpQ01102 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SelpQ01102 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SelpQ01102 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SelpQ01102 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SelpQ01102 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms