Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pde4dQ01063 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Pde4dQ01063 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pde4dQ01063 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pde4dQ01063 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde4dQ01063 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde4dQ01063 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde4dQ01063 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4dQ01063 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4dQ01063 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4dQ01063 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4dQ01063 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4dQ01063 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4dQ01063 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4dQ01063 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4dQ01063 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms