Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbp1Q00915 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp1Q00915 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp1Q00915 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms