Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Il6stQ00560 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Il6stQ00560 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Il6stQ00560 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Il6stQ00560 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms