Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb1Q00420 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabpb1Q00420 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabpb1Q00420 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms