Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx2Q00262 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx2Q00262 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx2Q00262 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx2Q00262 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx2Q00262 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx2Q00262 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx2Q00262 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx2Q00262 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx2Q00262 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx2Q00262 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx2Q00262 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Stx2Q00262 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx2Q00262 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms