Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scn1bP97952 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn1bP97952 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms