Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfdP97946 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfdP97946 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfdP97946 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VegfdP97946 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfdP97946 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VegfdP97946 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfdP97946 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfdP97946 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfdP97946 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfdP97946 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfdP97946 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfdP97946 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfdP97946 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VegfdP97946 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms