Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brca2P97929 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca2P97929 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca2P97929 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca2P97929 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brca2P97929 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brca2P97929 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Brca2P97929 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brca2P97929 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brca2P97929 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brca2P97929 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca2P97929 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms