Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama4P97927 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lama4P97927 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lama4P97927 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lama4P97927 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lama4P97927 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama4P97927 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lama4P97927 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lama4P97927 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lama4P97927 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama4P97927 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lama4P97927 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lama4P97927 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lama4P97927 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lama4P97927 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lama4P97927 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms