Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad4P97471 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad4P97471 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad4P97471 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad4P97471 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad4P97471 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad4P97471 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad4P97471 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad4P97471 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad4P97471 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms