Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx1P81068 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx1P81068 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx1P81068 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx1P81068 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irx1P81068 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irx1P81068 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irx1P81068 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.1 ms