Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tbx6P70327 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tbx6P70327 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms