Protein–RNA interactions for Protein: P70323

Tbx1, T-box transcription factor TBX1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1P70323 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbx1P70323 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbx1P70323 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx1P70323 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms