Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vamp7P70280 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vamp7P70280 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vamp7P70280 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vamp7P70280 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms