Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NficP70255 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NficP70255 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NficP70255 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NficP70255 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NficP70255 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NficP70255 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NficP70255 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NficP70255 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NficP70255 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NficP70255 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NficP70255 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NficP70255 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NficP70255 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NficP70255 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NficP70255 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NficP70255 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NficP70255 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NficP70255 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NficP70255 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NficP70255 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NficP70255 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NficP70255 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NficP70255 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NficP70255 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NficP70255 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NficP70255 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NficP70255 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NficP70255 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NficP70255 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NficP70255 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NficP70255 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NficP70255 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NficP70255 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NficP70255 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NficP70255 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NficP70255 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NficP70255 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NficP70255 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NficP70255 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NficP70255 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NficP70255 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NficP70255 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NficP70255 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NficP70255 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NficP70255 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NficP70255 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NficP70255 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NficP70255 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NficP70255 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NficP70255 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NficP70255 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NficP70255 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NficP70255 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NficP70255 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NficP70255 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NficP70255 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NficP70255 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NficP70255 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NficP70255 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NficP70255 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NficP70255 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NficP70255 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NficP70255 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NficP70255 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NficP70255 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NficP70255 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NficP70255 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NficP70255 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NficP70255 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NficP70255 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NficP70255 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NficP70255 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NficP70255 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NficP70255 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NficP70255 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NficP70255 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NficP70255 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NficP70255 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NficP70255 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NficP70255 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NficP70255 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NficP70255 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NficP70255 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NficP70255 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NficP70255 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NficP70255 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NficP70255 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NficP70255 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NficP70255 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NficP70255 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NficP70255 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NficP70255 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NficP70255 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NficP70255 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NficP70255 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NficP70255 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NficP70255 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NficP70255 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NficP70255 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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