Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrx1P63013 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx1P63013 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrx1P63013 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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