Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gnb1P62874 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gnb1P62874 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnb1P62874 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms