Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElobP62869 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElobP62869 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElobP62869 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElobP62869 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ElobP62869 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElobP62869 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElobP62869 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElobP62869 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElobP62869 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ElobP62869 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElobP62869 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ElobP62869 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElobP62869 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElobP62869 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElobP62869 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ElobP62869 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ElobP62869 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ElobP62869 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ElobP62869 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ElobP62869 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ElobP62869 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ElobP62869 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ElobP62869 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ElobP62869 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ElobP62869 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ElobP62869 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ElobP62869 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ElobP62869 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ElobP62869 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ElobP62869 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ElobP62869 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ElobP62869 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ElobP62869 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ElobP62869 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ElobP62869 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ElobP62869 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ElobP62869 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ElobP62869 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ElobP62869 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ElobP62869 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ElobP62869 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ElobP62869 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ElobP62869 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ElobP62869 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ElobP62869 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ElobP62869 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ElobP62869 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ElobP62869 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ElobP62869 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ElobP62869 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ElobP62869 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ElobP62869 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ElobP62869 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ElobP62869 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElobP62869 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElobP62869 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElobP62869 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElobP62869 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElobP62869 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ElobP62869 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ElobP62869 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ElobP62869 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ElobP62869 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ElobP62869 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ElobP62869 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ElobP62869 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ElobP62869 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ElobP62869 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ElobP62869 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ElobP62869 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElobP62869 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElobP62869 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElobP62869 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElobP62869 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElobP62869 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElobP62869 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElobP62869 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElobP62869 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElobP62869 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElobP62869 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElobP62869 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElobP62869 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElobP62869 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElobP62869 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElobP62869 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ElobP62869 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ElobP62869 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ElobP62869 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ElobP62869 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ElobP62869 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ElobP62869 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ElobP62869 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ElobP62869 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ElobP62869 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ElobP62869 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ElobP62869 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ElobP62869 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ElobP62869 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ElobP62869 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms