Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl23P62830 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl23P62830 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms