Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhobP62746 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhobP62746 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhobP62746 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhobP62746 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhobP62746 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RhobP62746 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhobP62746 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhobP62746 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhobP62746 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhobP62746 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhobP62746 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhobP62746 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhobP62746 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RhobP62746 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RhobP62746 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhobP62746 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhobP62746 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RhobP62746 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RhobP62746 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RhobP62746 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RhobP62746 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhobP62746 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhobP62746 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhobP62746 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhobP62746 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RhobP62746 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhobP62746 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhobP62746 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhobP62746 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhobP62746 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RhobP62746 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhobP62746 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhobP62746 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhobP62746 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhobP62746 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhobP62746 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RhobP62746 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhobP62746 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhobP62746 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RhobP62746 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RhobP62746 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhobP62746 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhobP62746 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhobP62746 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhobP62746 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhobP62746 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhobP62746 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhobP62746 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhobP62746 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhobP62746 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhobP62746 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RhobP62746 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhobP62746 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhobP62746 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhobP62746 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhobP62746 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhobP62746 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RhobP62746 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhobP62746 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhobP62746 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhobP62746 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhobP62746 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RhobP62746 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhobP62746 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RhobP62746 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhobP62746 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhobP62746 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhobP62746 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhobP62746 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhobP62746 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhobP62746 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhobP62746 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhobP62746 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhobP62746 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhobP62746 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhobP62746 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhobP62746 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhobP62746 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhobP62746 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhobP62746 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhobP62746 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RhobP62746 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhobP62746 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhobP62746 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhobP62746 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhobP62746 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhobP62746 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhobP62746 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhobP62746 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhobP62746 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhobP62746 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhobP62746 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhobP62746 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhobP62746 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhobP62746 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhobP62746 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhobP62746 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhobP62746 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhobP62746 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms