Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd3P62320 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd3P62320 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms