Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lrch1P62046 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lrch1P62046 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrch1P62046 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Lrch1P62046 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrch1P62046 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms