Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnd3P61588 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnd3P61588 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnd3P61588 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms