Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abce1P61222 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abce1P61222 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abce1P61222 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abce1P61222 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abce1P61222 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abce1P61222 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abce1P61222 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abce1P61222 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abce1P61222 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abce1P61222 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abce1P61222 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abce1P61222 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abce1P61222 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abce1P61222 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abce1P61222 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abce1P61222 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Abce1P61222 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abce1P61222 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abce1P61222 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abce1P61222 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abce1P61222 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abce1P61222 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms