Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scarf2P59222 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scarf2P59222 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scarf2P59222 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scarf2P59222 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scarf2P59222 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scarf2P59222 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scarf2P59222 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scarf2P59222 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scarf2P59222 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scarf2P59222 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scarf2P59222 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf2P59222 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scarf2P59222 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms