Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tlr8P58682 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tlr8P58682 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tlr8P58682 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tlr8P58682 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tlr8P58682 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms