Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Strn4P58404 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Strn4P58404 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Strn4P58404 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Strn4P58404 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Strn4P58404 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Strn4P58404 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Strn4P58404 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Strn4P58404 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Strn4P58404 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Strn4P58404 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Strn4P58404 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Strn4P58404 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Strn4P58404 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Strn4P58404 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.1 ms