Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl4P58321 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Uchl4P58321 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uchl4P58321 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uchl4P58321 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 362.3 ms