Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sssca1P56873 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sssca1P56873 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sssca1P56873 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms