Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp5bP56480 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5bP56480 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5bP56480 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms