Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox17P56394 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox17P56394 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox17P56394 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox17P56394 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox17P56394 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox17P56394 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox17P56394 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox17P56394 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox17P56394 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cox17P56394 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox17P56394 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox17P56394 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cox17P56394 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1117.8 ms