Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HccsP53702 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HccsP53702 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HccsP53702 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HccsP53702 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HccsP53702 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HccsP53702 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HccsP53702 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HccsP53702 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HccsP53702 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HccsP53702 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HccsP53702 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HccsP53702 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HccsP53702 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HccsP53702 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HccsP53702 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HccsP53702 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HccsP53702 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HccsP53702 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HccsP53702 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HccsP53702 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HccsP53702 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HccsP53702 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HccsP53702 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HccsP53702 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HccsP53702 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HccsP53702 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HccsP53702 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HccsP53702 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HccsP53702 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HccsP53702 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HccsP53702 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HccsP53702 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HccsP53702 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HccsP53702 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HccsP53702 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HccsP53702 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HccsP53702 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HccsP53702 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HccsP53702 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HccsP53702 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HccsP53702 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HccsP53702 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HccsP53702 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HccsP53702 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HccsP53702 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HccsP53702 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HccsP53702 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HccsP53702 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HccsP53702 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HccsP53702 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HccsP53702 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HccsP53702 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HccsP53702 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HccsP53702 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HccsP53702 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HccsP53702 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HccsP53702 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HccsP53702 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HccsP53702 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HccsP53702 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HccsP53702 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HccsP53702 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HccsP53702 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HccsP53702 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HccsP53702 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HccsP53702 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HccsP53702 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HccsP53702 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HccsP53702 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HccsP53702 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HccsP53702 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HccsP53702 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HccsP53702 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HccsP53702 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HccsP53702 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HccsP53702 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HccsP53702 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HccsP53702 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HccsP53702 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HccsP53702 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HccsP53702 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HccsP53702 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HccsP53702 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HccsP53702 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HccsP53702 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HccsP53702 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HccsP53702 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HccsP53702 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HccsP53702 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HccsP53702 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HccsP53702 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HccsP53702 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HccsP53702 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HccsP53702 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HccsP53702 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HccsP53702 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HccsP53702 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HccsP53702 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HccsP53702 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms